يبحث هذا التحليل في التغييرات التي تطرأ على سماة البروتين، ومواطن تكوينه ووجوده، وتعديلات البنية التحتية (التغييرات في مكونات الجلد التي لا يمكن رؤيتها إلا عن طريق الفحص المجهري الإلكتروني)

(IFM) Immunofluorescence Mapping يفحص مخطط التسلسل المناعي

البروتينات الموجودة في الجلد، ويمكن التعرف على البروتينات المرتبطة بـ انحلال الجلد الفقاعي بواسطة كواشف كيميائية معينة (الأجسام المضادة)، ومن خلال المقارنة بالجلد الطبيعي والصحي (عينة جلد عادية)، نتمكن من خلال هذه التقنية تحديد ومعرفة نسب البروتين المفقودة أو غيابها بين طبقات الجلد المختلفة ومن ثم تحديد درجة الإصابة